福建中医药大学图书馆创办于1958年，现有旗山校区总馆和屏山校区分馆两个馆区。经过60多年的发展，图书馆“淀积资源、传播文化、交流学术、服务师生”的职能日益彰显，成为学校的文献信息中心、学科赋能中心与中医药文化对外展示交流中心，在教学科研、人才培养和校园文化建设中发挥着重要作用。

截止2026年8月，馆藏纸质图书总量160万册（其中线装古籍图书2443种，12141册），电子图书167万册，电子期刊93.6万册，中外文数据库49个，形成了纸质文献与电子文献齐头并进的馆藏格局。文献资源基本覆盖了学校的各学科领域，为学校的教学科研和学科建设提供了信息资源保证。

图书馆设有阅读服务与文化拓展部、资源建设与信息技术部、检索教学与知识服务部、办公室等部门，以及中国中医药文献检索中心福建分中心、闽台中医药文化文献研究中心等2个中心。

图书馆秉持“以人为本”“服务至上”的理念，依托“超微新一代图书馆服务平台（LSP）”，提供书刊借阅、检索咨询、科技查新等多种服务，实现互联互通、开放共享服务。馆内开辟文化小区、研究小区、信息共享区、主题展区、创客空间、研学空间等功能区域，极大地提升了读者的阅读体验和研究需求。图书馆承担学校本科生与研究生信息检索课程的教学任务，《文献信息检索》获省级精品课程及省级精品在线开放课程，《医学文献检索与利用》获省级研究生教育精品课程。图书馆强化特色资源搜集和整理，致力于建设成为全国具有较大影响的区域性中医药文献收藏中心、文化研究中心和学术交流中心。通过校园VPN及CARSI身份认证，满足读者在校外访问学术文献数据资源的需求，实现“图书馆没有障碍，图书馆无处不在”的服务愿景。

图书馆秉持“读者第一，服务至上” 的理念，围绕学校发展大局，不断拓展服务领域，提升服务质量，为学校的 “双一流” 建设和全校师生医护员工的成长发展提供更加有力的支持。